新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间，让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求，细菌基因组测序可分为四种类型：细菌基因组Scanning、细菌基因组

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宏基因组测序是指对样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序，进行序列组装和基因注释，获得部分不可纯培养微生物的基因组序列，分析该环境下所有微生物基因集信息。

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外显子&目标区域测序是指利用特制的探针对感兴趣的蛋白编码区域DNA或某段特定序列进行富集，随后通过高通量测序技术对该目标区域进行深度测序，发现特定遗传信息，极大提高了基因组中外显子&目标区域的研究效率，显著降低了研究成本。可用于识别和研究复杂疾病如癌症、糖

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数字基因表达谱分析（Digital Gene Expression Tag  Profiling，DGE）是直接对某一物种或特定细胞在特定功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况。通过高通量测序一次可产生1千万个以上mRNA标签，可准确检测低丰度基因转录

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mRNA测序在检测基因表达的同时，还能够获取mRNA结构信息、识别可变剪切位点和cSNP突变、解析RNA编辑，从而获得更全面的mRNA信息。

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环境微生物多样性检测，是以样品中的微生物群落作为整体进行研究，通过对核糖体RNA高变区域（比如16S/18S/ITS等序列）或功能基因（如古菌的氨氧化基因等）进行PCR扩增和测序，然后分析相应环境下微生物群落的多样性和分布规律。

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Illumina公司新一代DNA高通量测序仪Genome Analyzer采用核心专利技术“DNA簇”和“可逆性末端终止”，具有高准确性、高通量、高灵敏性和低运行成本等优势。

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circRNA 是通过特殊的选择性剪切产生封闭环状结构的非编码 RNA。 circRNA 不受 RNA 外切酶的影响，比线性 RNA 表达更稳定。研究表明，某些特殊的 cirrcRNA 分子富含miR

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